Delimitation of some neotropical laccate Ganoderma (Ganodermataceae): molecular phylogeny and morphology
Date
Authors
Correia de Lima Júnior, Nelson
Baptista Gibertoni, Tatiana
Malosso, Elaine
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad de Costa Rica
Abstract
Description
taxonomists judge the current nomenclatural situation as chaotic and poorly studied in the neotropics. From this perspective, phylogenetic analyses inferred from ribosomal DNA sequences have aided the clarification of the genus status. In this study, 14 specimens of Ganoderma and two of Tomophagus collected in Brazil were used for DNA extraction, amplification and sequencing of the ITS and LSU regions (rDNA). The phylogenetic delimitation of six neotropical taxa (G. chalceum, G. multiplicatum, G. orbiforme, G. parvulum, G. aff. oerstedtii and Tomophagus colossus) was determined based on these Brazilian specimens and found to be distinct from the laccate Ganoderma from Asia, Europe, North America and from some specimens from Argentina. Phylogenetic reconstructions confirmed that the laccate Ganoderma is distinct from Tomophagus, although they belong to the same group. The use of taxonomic synonyms Ganoderma subamboinense for G. multiplicatum, G. boninense for G. orbiforme and G. chalceum for G. cupreum was not confirmed. However, Ganoderma parvulum was confirmed as the correct name for specimens called G. stipitatum. Furthermore, the name G. lucidum should be used only for European species. The use of valid published names is proposed according to the specimen geographical distribution, their morphological characteristics and rDNA analysis.
Ganoderma incluye especies de gran importancia económica y ecológica, sin embargo, su nomenclatura actual es caótica y poco estudiada en el neotrópico. En este estudio se utilizaron 14 muestras de Ganoderma y dos de Tomophagus recolectados en Brasil para la extracción de ADN, amplificación y secuenciación de las regiones ITS y LSU. La delimitación filogenética de seis táxones neotropicales fue discutida con base en especímenes brasileños y secuencias del GenBank. Estas especies mostraron ser distintas de los Ganoderma lacados de Asia, Europa, América del Norte y de algunos ejemplares de Argentina. Las reconstrucciones filogenéticas confirman que los Ganoderma lacados son distintos de Tomophagus, aunque pertenecen al mismo grupo. No se confirman los sinónimos de G. subamboinense a G. multiplicatum, de G. boninense a G. orbiforme y G. chalceum a G. cupreum. G. parvulum se confirma como el nombre correcto para G. stipitatum. G. lucidum sólo se debe utilizar para especies europeas. Por lo tanto, se propone el uso de nombres publicados válidamente de acuerdo con la distribución geográfica de las muestras, características morfológicas y análisis de ADNr.
Ganoderma incluye especies de gran importancia económica y ecológica, sin embargo, su nomenclatura actual es caótica y poco estudiada en el neotrópico. En este estudio se utilizaron 14 muestras de Ganoderma y dos de Tomophagus recolectados en Brasil para la extracción de ADN, amplificación y secuenciación de las regiones ITS y LSU. La delimitación filogenética de seis táxones neotropicales fue discutida con base en especímenes brasileños y secuencias del GenBank. Estas especies mostraron ser distintas de los Ganoderma lacados de Asia, Europa, América del Norte y de algunos ejemplares de Argentina. Las reconstrucciones filogenéticas confirman que los Ganoderma lacados son distintos de Tomophagus, aunque pertenecen al mismo grupo. No se confirman los sinónimos de G. subamboinense a G. multiplicatum, de G. boninense a G. orbiforme y G. chalceum a G. cupreum. G. parvulum se confirma como el nombre correcto para G. stipitatum. G. lucidum sólo se debe utilizar para especies europeas. Por lo tanto, se propone el uso de nombres publicados válidamente de acuerdo con la distribución geográfica de las muestras, características morfológicas y análisis de ADNr.
Keywords
Agaricomycetes, phylogenetic taxonomy, rDNA sequences, species delimitation, neotropics, Agaricomycetes, taxonomía filogenética, secuencias de ADNr, delimitación de especie, neotrópico