Generalización de dos métodos de detección de conglomerados. Aplicaciones en bioinformática.
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Authors
Rodríguez Corvea, Laureano
Casas Cardoso, Gladys M.
Grau Abalo, Ricardo
Pupo Meriño, Mario
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Abstract
This paper presents a modification to the temporal disease clusters methods inorder to apply them to other sciences. Particular specifications are shown in Scanand temporal Grimson techniques. The original data are transformed in a binary sequence:the value “one” represents the interest category and value “zero” correspondsto all other cases. Computational transformations of the algorithms are implementedusing Mathematica Package. Besides some interesting bioinformatics applications arepresented.Keywords: Temporal disease clusters, Scan method, Grimson method, Bioinformaticsapplications.
En este art´?culo se propone una modificaci´on a los m´etodos de detecci´on de conglomeradosde enfermos en el tiempo, para que puedan utilizarse en otras ramas delsaber. Se muestran especificaciones particulares en los m´etodos Scan y Grimson. Losdatos originales se transforman en una secuencia binaria donde los “unos” representanla categor´?a de inter´es y los “ceros” se corresponden con los dem´as casos. Las transformacionesparticulares de los algoritmos se implementaron en el paquete Mathematica.Adem´as se presentan varias aplicaciones interesantes del campo de la bioinform´atica.Palabras clave: Conglomerados temporales, m´etodo Scan, m´etodo de Grimson, aplicacionesbioinform´aticas.
En este art´?culo se propone una modificaci´on a los m´etodos de detecci´on de conglomeradosde enfermos en el tiempo, para que puedan utilizarse en otras ramas delsaber. Se muestran especificaciones particulares en los m´etodos Scan y Grimson. Losdatos originales se transforman en una secuencia binaria donde los “unos” representanla categor´?a de inter´es y los “ceros” se corresponden con los dem´as casos. Las transformacionesparticulares de los algoritmos se implementaron en el paquete Mathematica.Adem´as se presentan varias aplicaciones interesantes del campo de la bioinform´atica.Palabras clave: Conglomerados temporales, m´etodo Scan, m´etodo de Grimson, aplicacionesbioinform´aticas.
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http://revistas.ucr.ac.cr/index.php/matematica/article/view/286