Caracterización filogenética de Cucurbit yellow stunting disorder virus en cultivos de cucurbitáceas en Costa Rica

Abstract

La familia de las cucurbitáceas incluye muchas especies con valor alimentario y económico, pero su producción se ve afectada por enfermedades, entre ellas el virus del retraso del crecimiento amarillo de las cucurbitáceas (Cucurbit yellow stunting disorder virus, CYSDV). Este virus es transmitido por la mosca blanca (Bemisia tabaci y Trialeurodes vaporarium), y causa síntomas como clorosis interveinal, moteado clorótico y retraso del crecimiento. El objetivo de esta investigación fue identificar la presencia del CYSDV en cultivos de cucurbitáceas en Costa Rica y realizar un análisis filogenético de los aislamientos. De las 230 muestras analizadas, incluyendo melón, sandía y dos especies de calabaza, 50 fueron positivas para CYSDV. Se obtuvieron 26 secuencias del gen de la proteína de cubierta (CP) y 43 secuencias del gen de la proteína de choque térmico (HSP70h). El análisis filogenético del gen CP mostró un 100 % de identidad con una cepa de Guatemala, agrupando los aislados de Costa Rica en un solo clado y generando otro clado con aislados de Estados Unidos, España y Oriente Medio. Para el gen HSP70h, se identificaron valores de identidad superiores al 96 % con aislados de Estados Unidos, Oriente Medio y España. Sin embargo, estos aislados formaron un grupo independiente de los aislados costarricenses en los análisis filogenéticos. La variabilidad genética del CYSDV en Costa Rica es baja considerando las diferentes regiones y cultivos muestreados durante esta investigación. Este estudio es el primer informe oficial del CYSDV en Costa Rica.The Cucurbitaceae family includes many species with food and economic value, but their production is affected by diseases, including the Cucurbit yellow stunting disorder virus (CYSDV). This virus is transmitted by the whitefly (Bemisia tabaci and Trialeurodes vaporarium), and causes symptoms such as interveinal chlorosis, chlorotic mottling and stunting. The objective of this research was to identify the presence of CYSDV in cucurbit crops in Costa Rica and to perform a phylogenetic analysis of the isolates. Of the 230 samples tested, including melon, watermelon, and two species of squash, 50 were positive for CYSDV. Twenty-six sequences for coat protein gene (CP) and 43 sequences for heat shock protein gene (HSP70h) were obtained. Phylogenetic analysis of CP gene exhibited 100 % identity with a strain from Guatemala, grouping the Costa Rican isolates into a single clade and generating another clade with isolates from the United States, Spain and the Middle East. For the HSP70h gene, identity values higher than 96 % were identified with isolates from the United States, Middle East, Spain. However, these isolates formed an independent group from the Costa Rican isolates in the phylogenetic analyses. The genetic variability of CYSDV in Costa Rica is low considering the different regions and crops sampled during this research. This study is the first official report of CYSDV in Costa Rica.