Estudio de variabilidad genética en Musa sp. con la técnica de ADN polimórfico amolifica aleatoriamente (RAPD)

Abstract

Los bananos y los plátanos representan una fuente vital para la alimentación de millones de personas en todo el mundo. Se cultivan en más de 110 países y sólo el 10 % de su producción se destina al mercado, constituyendo un alimento de subsistencia para la mayoría de de los países con economía en vías de desarrollo. La organización y caracterización del germoplasma tiene gran importancia para enfrentar de forma sostenible las limitaciones que afectan el cultivo. En esta investigación se utilizó la técnica de ADN polimórfico amplificado aleatoriamente (RAPD) para estudiar la variabilidad genética de las introducciones en Musa presentes en los bancos de germoplasma de la Corporación Bananera Nacional de Costa Rica (Corbana) y del Centro Agronómico de Invesitgación y Enseñanza (CATIE). Los productos de amplificación de PCR fueron separados en geles de agarosa y leídos según el criterio de presencia (1) y ausencia (0) de bandas. Estos datos se utilizaron para generar una matriz de similitud siguiendo el criterio de Jaccard, a partir del cual se confeccionó una árbol filogenético por el método de "Neighbour Joining Tree". El polimorfismo revelado por esos marcadores moleculares probados sirvió para separar los individuos por su respectivos genomas, revelando que existe una extensa variabilidad genética entre los clones con genoma AA y una escasa variabilidad genética entre los cultivares triploides (AAA, AAB, ABB). Lo anterior sugiere el mismo origen evolutivo para la totalidad de éstos. Sin embargo, se considera que mediante un estudio más amplio de las características que, como grupo, comparte con los diplodes es posible demostrar su verdadero origen.

Bananas and plantains are very important food crops for millions of persons around the world. These crops are cultivated in more than 110 countries but only 10% of their overall production is actually marketed. This means that these are mainly subsistence crops. Germplasm organization and characterization is a very important tool in developing strategies to overcome constraints affecting these crop. In this work, the random amplified polymorphic DNA technique (RAPD), using operon primers, was used to evaluate the genetic variability of Musa spp accessions in the germplasm collections of the National Banana Corporation of Costa Rica (CORBANA) and the Agronomic Center for Research and Teaching (CATIE) also in Costa Rica. PCR amplification products were separated on agarose gels and read according to the criteria of presence (1) and absence (0) of bands. These data were used to generate a similarity matrix following Jaccard's criteria, from which a phylogenetic tree was constructed by the “Neighbour Joining Tree” method. The polymorphism revealed by these molecular markers was used to separate the individuals by their respective genomes, revealing that there is extensive genetic variability among the clones with AA genome and little genetic variability among the triploid cultivars (AAA, AAB, ABB). This suggests the same evolutionary origin for all of them. However, it is considered that through a broader study of the characteristics that, as a group, they share with the diploids, it is possible to demonstrate their true origin.