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Genetic diversity of roselle in Guatemala revealed by AFLP markers.

Diversidad genética de rosa de jamaica en Guatemala revelada por marcadores AFLP.

dc.creatorPonciano Samayoa, Karla Melina
dc.creatorHidalgo Villatoro, Sergio Gonzalo
dc.date2012-06-01
dc.date.accessioned2016-05-02T20:53:56Z
dc.date.available2016-05-02T20:53:56Z
dc.identifierhttp://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/2135
dc.identifier10.15517/am.v23i1.2135
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10669/17494
dc.descriptionGenetic diversity of roselle in Guatemala revealed by AFLP markers. The objective of this study was to characterize a collection of 17 genotypes of roselle that were collected in Guatemala. During July 2010/ May 2011, twelveselective combinations of AFLP were amplified at Instituto de Ciencia y Tecnología Agrícolas (ICTA), to identify clusters and to analyze the genetic diversity within the collection. A 98% of polymorphic loci was observed, nine per amplification in average. Five selective primer pairs were high informative and are recommended for future investigations.No duplicated genotypes were identified. The clustering and correspondence analysis identified three closely related groups. A fourth group included accession 205, characterizedby early maturity and high yield. The clusters formed were similar to those identified in a previous agromorphological characterization. Probably, there is a genetic linkage between AFLPs and quantitative trait loci (QTLs) that can beused in marker-assisted selection. The genetic diversity (Nei) was high (0.3053). The genetic differentiation (GST) between groups was 57.62%. The genetic variability within clusters was lower (42.38%) and probably due to the low genetic flow (Nm=0.3678) commonly found in in breed species.en
dc.descriptionDiversidad genética de rosa de jamaica en Guatemala revelada por marcadores AFLP. El objetivo de este estudio fue caracterizar la diversidad genética existente en unacolección de diecisiete genotipos de rosa de jamaica cultivados en Guatemala. Durante el período julio 2010/mayo2011,en el Instituto de Ciencia y Tecnología Agrícolas (ICTA) seamplificaron doce combinaciones selectivas AFLP de las cuales cinco fueron altamente informativas. Se observó un98% de loci polimórficos, con un promedio de nueve por amplificación selectiva. Se estableció que no hay genotipos duplicados en la colección. El análisis de agrupamientos y decorrespondencia identificó tres grupos muy cercanos entresí. El cuarto grupo fue conformado por la accesión 205 quese caracteriza por ser muy precoz y tener alto rendimiento respecto al resto. Los agrupamientos formados coincidieroncon los conglomerados identificados en la caracterización agromorfológica realizada a la colección según su precocidad,días a cosecha y rendimiento. Es probable que existaun ligamiento entre AFLPs y loci de características cuantitativas, que puede ser aprovechado en selección asistida pormarcadores. La diversidad genética (Nei) fue alta (0,3053)de la cual el 57,62% se debió a la diferenciación entre grupos(GST). La variación genética dentro de los grupos fue menor(42,38%) y probablemente se debe al bajo flujo genético(Nm=0,3678) que hay en una especie autógama.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherUniversidad de Costa Ricaes-ES
dc.rightsCopyright (c) 2014 Agronomía Mesoamericanaes-ES
dc.sourceMesoamerican Journal of Agronomy; Agronomía Mesoamericana: Vol 23, No 1; 63-71en
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; Agronomía Mesoamericana: Vol 23, No 1; 63-71es-ES
dc.source2215-3608
dc.source1021-7444
dc.titleGenetic diversity of roselle in Guatemala revealed by AFLP markers.en
dc.titleDiversidad genética de rosa de jamaica en Guatemala revelada por marcadores AFLP.es-ES
dc.typeartículo original


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